Certains défunts, pour lesquels un prélèvement est envisagé se révèlent être non prélevables pour des raisons médicales ou logistiques. Pour d'autres, le prélèvement est refusé. Soit parce que le défunt lui-même, s'est préalablement inscrit au registre national des refus, soit parce qu'il a fait valoir son opposition auprès de ses proches par témoignage écrit, ou oral, de son vivant.